京东自营店铺的变更规则要求商家在申请主体变更时必须满足特定条件。

首先，店铺必须处于正常营业状态且运营时间超过一年。

其次，店铺不得有拖欠费用的情况。此外，房地产、本地生活和拍卖部分类目不允许进行店铺主体变更。

在符合上述前提条件下，店铺每年只能进行一次主体变更。同时，新旧店铺主体需为同一法人，并且新的主体不能存在任何处罚、投诉、诉讼仲裁或执行等问题。

变更流程包括：商家向对应的采销提交变更申请并获取同意，随后提供相关资料，包括工商局出具的企业名称变更核准通知书或市场监督管理局出具的变更备案通知书、京东供应商出具的公司名称变更函（确保名称与合同签署主体一致）以及变更后新公司的营业执照。