阿里健康设定的合作企业标准包括： 

1. 必须是拥有合法营业执照的企业实体。 

2. 多数商品类别要求企业的注册本金需达到或超过100万元。 

3. 企业应合法成立并运营满一年以上。 

4. 申请入驻天猫店铺的企业需具备一般纳税人资格。 

对于阿里健康大药房，所需的资质文件涵盖： 1. 公司的营业执照副本。 

2. 公司银行账户的开户许可证。 

3. 支付宝授权书，以证明支付渠道的合法性。 

4. 公司的广告宣传资料，以便了解其市场定位和宣传策略。

5. 提供产品详情介绍，确保产品的透明度和可追溯性。 

6. 详细的品牌背景介绍，展示品牌的市场影响力和信誉度。