申请入驻京东自营店铺需遵循以下流程：

注册账户：访问京东自营供应商的在线入驻系统，注册企业账户。

提交资料：依照系统规定，提交以下资质文件：

营业执照、税务登记证、组织机构代码证、开户银行许可证及增值税一般纳税人资格证（已整合为一证）。

销售品牌的商标注册证或完整授权书。

其他产品相关资质，如3C认证等。

等待审核：提交资料后，预计需等待约7个工作日进行审核。

创建店铺：一旦审核通过，可在供应商后台创建自营店铺。

请确保所提交的资料真实、准确且有效。