在申请京东自营店铺经营主体变更的过程中，必须确保所涉店铺符合以下标准：店铺应为正常营业的京东自营店铺，运营时间需超过一年，且无拖欠费用。值得注意的是，房地产、本地生活及拍卖相关类目不适用于此次主体变更。

根据京东的规定，每个店铺每年只能进行一次经营主体变更。此外，新旧经营主体需由同一法人代表，并确保申请变更的主体未涉及任何处罚、投诉、诉讼仲裁或执行等问题。

变更流程如下：商家首先需要与对应的采销部门联系并提交变更申请。一旦采销部门同意，商家需提供包括工商局出具的企业名称变更核准通知书、市场监督管理局的变更(备案)通知书以及供应商出具的公司名称变更函等文件，确保变更函中的京东机构名称与合同签署主体一致。Zui后，还需提交新公司的营业执照作为变更证明。

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