天猫的入驻流程中，申请被驳回的原因可以归纳为以下几个方面：

商标问题是主要障碍之一。天猫要求商家必须持有有效的商标注册证，通常是指R标。对于某些商品类别，可能会接受TM标，但是不接受纯图形商标。若商家的商标是经过转让获得的，那么需要提交相应的转让证明文件。

品牌在市场上的影响力也是评估的关键因素。天猫会对申请入驻的品牌进行市场影响力的评估。如果一个品牌在市场中的影响力不足，那么它可能不满足天猫的入驻标准。

产品品类的市场饱和度也是一个重要考量。对于某一特定的产品类别，如果已经有大量的商家申请入驻，导致该市场的接近饱和状态，天猫可能会优先选择那些表现更为出色的商家。

尽管存在上述可能导致申请被驳回的因素，但这并不意味着商家无法重新申请入驻。如果在入驻过程中遇到任何困难，商家可以考虑寻求专业服务商的帮助。